蛋白质设计

苹果机器学习研究团队最近发表了一个叫SimpleDesign的模型，论文登在《TransactionsonMachineLearningResearch》上，预印本也已公开。它要解决的问题是蛋白质协同设计——同时给出氨基酸序列和对应的三维结构。这件事在药物、酶、抗体和生物材料的早期研发里都用得上。目前主流做法是“两步走”：先训练一个自编码器，把连续的蛋白质三维结构压缩成离散的“结构标记”，再在这个